In den ersten drei Semestern müssen 9 meeresbiologische Module (
Lebensraum Meer, Stoffkreisläufe I, Ökophysiologie aquatischer Organismen, Phykologie, Marine Tiere, Stoffkreisläufe II, regionale marine Ökologie, Mikrobielle und molekulare Ökologie, Vertiefungsmodul) und ein nichtbiologisches Modul (
Physikalische, chemische, geologische und statistische Grundlagen) belegt werden. Im 3. Semester besteht die Möglichkeit zur Spezialisierung in den Modulen
regionale marine Ökologie und
Vertiefungsmodul, in denen eine enge Verzahnung mit Forschungsaktivitäten der universitären und außeruniversitären Einrichtungen stattfindet. Im 4. Semester folgt die Master-Arbeit.